Järgnev on väljavõte sellest Ma sisaldan paljusid , autor Ed Yong.
Maja, kus ma seisan, on platooniline nägemus üle-Ameerika äärelinna idüllist. Väljas on valged klambrilauad, verandal kiiktool ja lapsed sõidavad jalgratastega ringi. Toas on rohkem ruumi, kui Jack Gilbert ja tema naine Kat teavad, mida teha. Nagu minagi, on nad britid ja harjunud ruumide hubastamiseks. Nad on ka soojad ja heatujulised: Jack on energiline derviš, Kat on aga tasakaalukas ja maandatud. Üks nende poegadest, Dylan, vaatab multikaid. Teine, Hayden, üritab talle kõige paremini teadaolevatel põhjustel mulle rusikaga vastu põrgu lüüa. Kaitsen end vastu köögileti taganedes ja tassi teed imetades. Ja seda tehes eemaldan ma passiivselt mikroobe kogu tassist, letist ja ülejäänud sellest kaunilt sisustatud köögist.
Ausalt öeldes on ka Gilbertid. Nagu oleme näinud, eraldame meie, inimesed, koos hüäänide, elevantide ja mägradega meid ümbritsevasse õhku bakterite lõhnu. Kuid me vabastame ka bakterid ise. Me kõik külvame maailma pidevalt oma mikroobidega. Iga kord, kui puudutame eset, jätame sellele mikroobse jälje. Iga kord, kui kõnnime, räägime, kratsime, segame või aevastame, heidame kosmosesse isikupärastatud mikroobipilve. Iga inimene aerosooliks teeb umbes 37 miljonit bakterit tunnis. See tähendab, et meie mikrobioom ei piirdu meie kehaga. See ulatub pidevalt meie keskkonda. Kui istusin siia sõites Gilberti autosse, veritsesin tema istmelt mikroobid. Nüüd, kui ma laman tema köögiletil, annan sellele autogrammi oma bakteritega. Jah, ma sisaldan paljusid, kuid ainult mõnda neist; ülejäänu ulatun ma maailma nagu elav aura.
Nende aurade analüüsimiseks pühkis Gilbertid hiljuti oma tulede lüliteid, ukselinke, köögilette, magamistubade põrandaid ning oma käsi, jalgu ja nina. Nad tegid seda iga päev kuus nädalat. Nad värbasid ja koolitasid sama tegema veel kuus perekonda, sealhulgas üksikisikuid, paare ja perekondi. Selle uuringu – kodu mikrobioomi projekti – tulemused näitasid, et igal kodul on omanäoline mikrobioom, mis pärineb suures osas seal elavatelt inimestelt. Nende kätebakterid katavad valguse lülitid ja ukselingid. Nende jalamikroobid katavad põrandaid. Nende nahaputukad satuvad köögipindadele. Ja see kõik toimub hämmastava kiirusega. Kolm vabatahtlikku kolisid uuringu käigus koju ja nende uued elukohad omandasid kiiresti vanade elukohtade mikroobse iseloomu, isegi kui ühel juhul oli selleks vanaks majutuskohaks hotellituba. 24 tunni jooksul pärast uude kohta kolimist kirjutame selle üle oma mikroobidega, muutes selle meie enda peegelduseks. Kui inimesed kutsuvad teid 'koduseks tegema', pole teil ega neil selles küsimuses tegelikult valikut.
Vahetame ka oma majakaaslaste mikroobe. Gilberti meeskond leidis, et toakaaslastel on rohkem mikroobe kui lahus elavatel inimestel ja paarid on mikroobide poolest veelgi sarnasemad. ('Kõik, mis ma olen, ma annan teile ja kõik, mis mul on, jagan teiega,' nagu öeldakse abielutõotuses.) Ja kui läheduses on koer, muutuvad need sidemed ülimalt tugevaks. 'Koerad toovad baktereid väljastpoolt sisse ja suurendavad mikroobide liikumist inimeste vahel,' ütleb Gilbert. Tema tulemuste ja Susan Lynchi töö põhjal, mis näitas, et koeratolm sisaldab allergiat pärssivaid mikroobe, said Gilbertid endale oma koera. Ta on ingveri ja valge segu kuldsest retriiverist, collie'st ja Suurtest Püreneedest, kes vastab kapten Beau Diggleyle. 'Nägime kodu mikroobide mitmekesisuse suurendamise eeliseid ja tahtsime tagada, et meie lastel oleks see võime oma immuunsüsteemi treenida,' ütleb Gilbert. 'Hayden pani talle nime; kust see nimi tuli, Hayden? Hayden vastab: 'Minu peast.'
Ükskõik, kas koer või inimene, kõik loomad elavad mikroobide maailmas. Ja selles maailmas liikudes muudame me selles olevaid mikroobe. Reisides Chicagosse Gilbertite juurde, olen jätnud oma nahamikroobid nende koju, hotellituppa, mõnesse kohvikusse, mitmesse taksosse ja ühe lennukiistmele. Hea kapten Diggley on udune kanal, mis viib mikroobid Naperville'i pinnasest ja veest Gilberti elukohta. Hawaii bobteil kalmaar, tuleb koit, loputab oma helendavat Vibrio fischeri partnerid ümbritsevasse vette. Hüäänid pihustavad rohuvartele mikroobset graffitit. Ja me kõik tervitame pidevalt mikroobe oma kehasse ja sisse, olgu siis sissehingamise või allaneelamise, puudutuste või jalgu, vigastuste või hammustuste kaudu. Meie mikrobioomidel on laiaulatuslikud kõõlused, mis juurutavad meid laias maailmas.
Gilbert tahab neid seoseid mõista. Ta tahab olla inimkeha kõikenägev piiriametnik, kes teab täpselt, millised mikroobid tulevad sisse (ja nende lähtekohta) ja millised on lahkumas (ja nende sihtkoht). Kuid inimesed teevad tema töö väga keeruliseks. Me suhtleme nii paljude erinevate objektide, inimeste ja kohtadega, et mõne konkreetse bakteri tee jälgimine muutub õudusunenäoks. 'Ma olen ökoloog; Tahan kohelda inimest nagu saart, ”ütleb ta. 'Aga mulle sõna otseses mõttes ei lubata. Tegin ettepaneku võtta mõned inimesed ja lukustada nad kuueks nädalaks ruumi ning institutsioonide hindamisnõukogu ütles eitavalt.
Sellepärast pöördus ta delfiinide poole.
'Mitu näidist soovite?' küsib loomaarst Bernie Maciol. 'Kui palju olete teinud?' ütleb Gilbert.
'Kolm.'
'Kas saate neid koopiaid teha? Ja võib-olla mõni muu naha sait? Aga kaenlaalune? Ei, mitte kaenlaalused. Mis iganes see on. Mida te nimetate delfiini kaenlaaluseks?'
Oleme Sheddi akvaariumi delfiinide näitusel – suures paagis, millest jäävad silma kunstlikud kivid ja puud. Must-sinises vesiülikonnas treener Jessica istub vette ja patsutab käega selle pinda. Vaikse ookeani valgeküljeline delfiin nimega Sagu ujub üles. Ta on ilus loom, nahaga nagu lamineeritud söejoonis. Ta on ka sõnakuulelik: kui Jessica hoiab oma käsi peopesad allapoole ja viibutab nendega küljele, siis Sagu rullub ümber ja paljastab oma piimvalge kõhu. Maciol sirutab käe risti, tampoonib vatitikuga Sagu kaenlaalust, suleb selle torusse ja annab selle tagasi Gilbertile. Ta teeb sama kahe teise delfiini, Kri ja Piquet'ga, kes vaikselt oma treenerite kõrval möllavad.
'Oleme võtnud proove puhumisavast, väljaheitest ja nahast,' räägib Jessica. „Lõuaava jaoks toetan nende pea käes, asetan augu kohale agariplaadi ja koputan, et delfiin sunniviisiliselt välja hingaks. Roojaproovi jaoks keeran need ümber, sisestan väikese kummikateetri ja tõmban selle välja. Meil siin kakapuudust pole.'
See akvaariumi mikrobioomi projekt pakub Gilbertile seda, mida ta ei saa oma Naperville'i majast ega mõnest muust kodust, mida ta proovis on – omamoodi kõiketeadmist. Siin on loomad, kelle keskkond on täielikult teada. Kõike vee kohta – temperatuuri, soolsust, kemikaalide sisaldust – saab mõõta ja seda tehakse regulaarselt. Siin saab Gilbert analüüsida delfiinide kehade, vee, toidu, paakide, treenerite, käitlejate ja õhu mikrobioomi ning ta on seda teinud üks kord päevas kuue nädala jooksul. 'Need on tõelised loomad, kellel on oma tõelised mikrobioomid, kes elavad reaalses keskkonnas, ja oleme katalooginud kõik mikroobide koostoimed, mis neil selle keskkonnaga on, ' ütleb ta. Ja see peaks andma talle enneolematu ülevaate looma kehas olevate ja ümbritseva maailma mikroobide vahelistest seostest.
Ma sisaldan paljusid
OstaAkvaariumil on mitu sellist projekti, et parandada oma laengute eluiga. Bill Van Bonn, Sheddi loomatervishoiu asepresident, räägib mulle, et kogu 3 miljoni gallonine veevarustus peamises okeanaariumis läbis varem elu toetava ahela, mis puhastas ja filtreeris seda iga kolme tunni järel. „Teate, kui palju energiat kulub selle vee lükkamiseks? Miks me seda nii sageli teeme? Sest: me teeme selle vee nii puhtaks, et see oleks absoluutselt parim asi, ”ütleb ta pilkavalt gung-ho tooniga. „Aga kui me seda toetame ja teeme poole vähem, mis juhtub! Mitte midagi! Vee keemia ja loomade tervis tegelikult paranevad!
Van Bonn kahtlustab, et sanitaartingimuste pildistamisel läksid nende intensiivsed puhastusrežiimid liiga kaugele. Lõppkokkuvõttes eemaldasid nad akvaariumikeskkonnast mikroobid, takistades küpsetel ja mitmekesistel kogukondadel end sisse seadmast ning luues võimalused umbrohtudele ja kahjulikele liikidele ära kasutada. Tundub tuttav? Just seda teevad antibiootikumid haiglapatsientide soolestikus. Nad loovutavad selle looduslike mikroobide ökosüsteemi ja võimaldavad nende asemel õitseda konkureerivatel patogeenidel, nagu C-diff. Mõlemas olukorras on steriilsus needus, mitte eesmärk, ja mitmekesine ökosüsteem on parem kui vaesunud ökosüsteem. Need põhimõtted on samad, olenemata sellest, kas me räägime inimese soolest või akvaariumi mahutist või isegi haiglaruumist.
'Mina olen dr Jack Gilbert ja see on haigla,' ütleb Jack Gilbert, viipab pöidlaga tema selja taha paistva tohutu haigla poole.
Oleme praegu Chicago ülikooli hooldus- ja avastuskeskuses, läikivas uues hoones, mis näeb välja nagu hiiglaslik ooperivärav, millel on mitu halli, oranži ja musta kihti. Gilbert seisab selle ees ja teeb korduvalt reklaamvideot. Ma ei ole veendunud, et kaameramehe mikrofon võtab Chicago halastamatu tuule peale korralikku heli. Olen rohkem veendunud, et Gilbert on väga külm. Ja ma olen täiesti veendunud, et jah, see on tõepoolest haigla.
Vahetult enne selle avamist 2013. aasta veebruaris juhtis Gilberti õpilane Simon Lax teadlaste meeskonda läbi jubedalt tühjade koridoride, relvastatud Q-otsikute kottide ja plaaniga. Nad pühkisid läbi kümne patsiendiruumi ja kahe õepunkti, mis paiknesid kahel korrusel: üks lühiajalistele patsientidele, kes taastuvad plaanilisest operatsioonist, ja teine pikaajalistele patsientidele, nagu vähihaiged ja siirdatud patsiendid. Kuid üheski toas ei elanud veel ükski inimene. Nende ainsad elanikud olid mikroobid, mida Laxi meeskond kogus. Nad pühkis puhtaid põrandaid, sätendavaid voodipiirdeid ja kraane ning täiuslikult volditud linasid.
Nad kogusid proove tulede lülititest, ukselinkidest, tuulutusavadest, telefonidest, klaviatuuridest ja muust. Lõpuks paigaldasid nad ruumidesse andmelogerid, mis mõõdaksid valgust, temperatuuri, niiskust ja õhurõhku, süsinikdioksiidi monitorid, mis registreeriksid automaatselt, kui ruum on hõivatud, ja infrapunaandurid, mis suudavad tuvastada, millal inimesed sisenesid või lahkusid. Pärast pidulikku avamist jätkas meeskond oma tööd, kogudes iganädalaselt rohkem proove tubadest ja neis viibivatest patsientidest.
Nii nagu teised on katalooginud vastsündinud lapse areneva mikrobioomi, on Gilbert esimest korda katalooginud vastsündinud hoone areneva mikrobioomi. Tema meeskond tegeleb praegu andmete analüüsimisega, et välja selgitada, kuidas inimeste olemasolu on muutnud ehitise mikroobset iseloomu ja kas need keskkonnamikroobid on elanike sekka tagasi voolanud. Kusagil pole need küsimused olulisemad kui haiglas. Seal võib mikroobide voog tähendada elu või surma – palju surmajuhtumeid. Arengumaades haigestub umbes 5–10 protsenti haiglatesse ja muudesse tervishoiuasutustesse sisse logivatest inimestest seal viibimise ajal mingisuguse nakkuse ja haigestub just nendes kohtades, mis on mõeldud nende tervise parandamiseks. Ainuüksi USA-s tähendab see umbes 1,7 miljonit nakatumist ja 90 000 surmajuhtumit aastas. Kust pärinevad nende nakkuste taga olevad patogeenid? Vesi? Ventilatsioonisüsteem? Saastunud varustus? Haigla personal? Gilbert kavatseb selle välja uurida. Tema meeskonna kogutud tohutute andmete abil peaks ta suutma jälgida patogeenide liikumist, näiteks valguslülitist arsti käe ja patsiendi voodipiirdeni. Ja ta peaks suutma välja töötada viise, kuidas seda eluohtlikku liiklust piirata.
See pole uus probleem. Alates 1860. aastatest, mil Joseph Lister oma haiglas steriilseid tehnikaid kasutusele võttis, on puhastusrežiimid aidanud pidurdada patogeenide levikut. Lihtsad meetmed, nagu kätepesu, on kahtlemata päästnud lugematu arv elusid. Kuid nii nagu oleme liiale läinud tarbetute antibiootikumide võtmisega või antibakteriaalsete desinfitseerimisvahenditega vahutamisega, oleme ka oma hoonete – isegi haiglate – puhastamisega liiale läinud. Näiteks kulutas üks USA haigla hiljuti umbes 700 000 dollarit antibakteriaalsete ainetega immutatud põrandakatete paigaldamiseks, kuigi neil puudusid tõendid selliste meetmete toimimise kohta. Need võivad isegi asja hullemaks muuta. Nagu delfiinide aedikus ja inimese soolestikus, on võib-olla meie haiglate steriliseerimise eesmärk tekitanud meie hoonete mikrobioomides düsbioosi. Eemaldades kahjutud bakterid, mis muidu takistaksid patogeenide kasvu, oleme võib-olla tahtmatult loonud ohtlikuma ökosüsteemi.
'Tahate tuua sisse mikroobid, mis on healoomulised või ei suhtle eriti palju, ja lihtsalt asustada pindu,' lisab teine Gilberti õpilane Sean Gibbons. 'Mitmekesisus on hea.' Liiga kaugele viidud kanalisatsioon võib põhjustada mitmekesisuse kokkuvarisemise. Gibbons näitas seda avalikke tualette uurides. Ta avastas, et põhjalikult nühkitud tualettruumid koloniseerivad esmalt väljaheite mikroobid, mis paiskuvad õhku keerleva loputatud vee abil. Lõpuks konkureerivad need liigid mitmekesiste nahamikroobide poolt, kuid kui tualettruumi uuesti nühkima hakatakse, lähevad kogukonnad tagasi algusesse. Niisiis, siin on iroonia: tualettruumid, mida puhastatakse liiga sageli, on tõenäolisemalt kaetud fekaalibakteritega.
Oregonis elav insenerist ökoloogiks saanud Jessica Green leidis sarnase mustri ka konditsioneeritud haiglaruumides hõljuvate mikroobide seas. 'Ma eeldasin, et siseõhu mikroobikooslus on välisõhu alamhulk,' ütleb ta. 'Mind üllatas tõesti, et me nägime nende kahe vahel vähe või üldse mitte kattumist.' Õues oli õhk täis taimedest ja pinnasest pärit kahjutuid mikroobe. Siseruumides sisaldas see ebaproportsionaalselt palju potentsiaalseid patogeene, mis on välismaailmas tavaliselt haruldased või puuduvad, kuid mis olid välja lastud haiglaelanike suust ja nahast. Patsiendid hautasid tõhusalt oma mikroobimahlas. Ja parim viis selle parandamiseks oli märkimisväärselt lihtne: avage aken.
Alates Minus on palju: mikroobid meie sees ja suurem vaade elule autor Ed Yong. Autoriõigus 2016 Ed Yong. Väljavõte Ecco loal, HarperCollins Publishersi jäljend.